В соответствии с распоряжением Московского городского совета № 13/66 от 24.04.1961 года приказом по службе сети треста «Мосводопровод» №64 05.05.1961 на базе водопроводно-канализационного предприятия в городе Химки образован филиал 7-го водопроводного участка треста «Мосводоканал». Одновременно, приказом по управлению водопроводно-канализационного хозяйства Мособлисполкома от 05.05.1961 года №18, произошло разделение водопровода и канализации. Канализационное хозяйство было передано с 15.05.1961 года в Тушинский трест «Мосочиствод».
На основании постановления СМ РСФСР от 22.12.61 года №1512 и решения Мособлисполкома от 29.12.1961 года №1361 приказом по Московскому областному отделу коммунального хозяйства от 21.01.1962 года №9 на базе филиала №7 водопроводного участка треста «Мосводопровод» с 01.02.1962 года был образован Химкинский аварийно-водопроводный участок подведомственный тресту «Мосводоканал».
Московским областным отделом коммунального хозяйства от Управления водопроводно-канализационного хозяйства Мособлисполкома приняты водопроводно-канализационные сооружения и сети.
Приказом по тресту «Мосводоканал» от 22 января 1965 года аварийно-водопроводный участок переименован в производственное управление водопроводно-канализационного хозяйства города Химки.
Решением Исполкома Мособлсовета от 23.04.1987 года №567/4 «Об образовании районных и городских производственно-технических объединений городского хозяйства Главного Управления городского хозяйства Мособлисполкома» и приказом Главного Управления городского хозяйства Московской области от 05.05.1987 №25, на базе действующих предприятий и организаций теплоэнергетического, водопроводно-канализационного, жилочного и коммунального хозяйства города Химки и Сходня создано Химкинское производственно-техническое объединение городского хозяйства.
В соответствии с постановлением Главы Химкинского района Московской области от 10.11.2000 года на основании Распоряжения КУИ №355 от 13.11.2000 года образовано Муниципальное унитарное предприятие «Химкинский Водоканал». Зарегистрировано предприятие 15 ноября 2000 года за №50:10:02267.